1- Copiar cada arquivo utilizado do RTP para suas pastas adequadas no seu jogo: CharSet, ChipSet, Music, Sound, etc.

2- Copiar o arquivo "Harmony.dll" da pasta do editor do RPG Maker 2000 ou 2003 para o mesmo lugar do "RPG_RT.INI" do seu jogo.

3- Abrir o arquivo "RPG_RT.INI" e adicionar na última linha: "FullPackageFlag=1".

Resultado Final:
[RPG_RT]
GameTitle=Nome do seu jogo (aparecerá na janela)
MapEditMode=1
MapEditZoom=1
FullPackageFlag=1

1- Copiar cada arquivo utilizado do RTP para suas pastas adequadas no seu jogo: CharSet, TileSets, Fonts, BGM, SE, etc.

2- Copiar o arquivo "RGSS104E.dll" (DLL diferente do VX) da pasta do editor do RPG Maker XP para o mesmo lugar da "GAME.INI" do seu jogo.

3- Abrir o arquivo "GAME.INI" e alterá-lo apagando as linhas de "RTP=".

Resultado Final:
[Game]
Library=RGSS104E.dll
Scripts=Data\Scripts.rxdata
Title=Nome do seu jogo (aparecerá na janela)

1- Copiar cada arquivo utilizado do RTP para suas pastas adequadas no seu jogo: CharSet, TileSets, Fonts, BGM, SE, etc.

2- Copiar o arquivo "RGSS202E.dll" (DLL diferente do XP) da pasta do editor do RPG Maker VX para o mesmo lugar da "GAME.INI" do seu jogo.

3- Abrir o arquivo "GAME.INI" e alterá-lo apagando as linhas de "RTP=".

Resultado Final:
[Game]
Library=RGSS202E.dll
Scripts=Data\Scripts.rxdata
Title=Nome do seu jogo (aparecerá na janela)

1- Copiar cada arquivo utilizado do RTP para suas pastas adequadas: CharSet, TileSets, Fonts, BGM, SE, etc.

2- Copiar o arquivo "RGSS301.dll" (DLL diferente do XP e VX) da pasta do editor do RPG Maker VX Ace para a pasta "System" do seu jogo.

3- Copiar a pasta "Fonts" do RTP do RPG Maker VX Ace para o mesmo lugar do "GAME.EXE" do seu jogo.

4- Abrir o arquivo "GAME.INI" e alterá-lo apagando as linhas de "RTP=".

Resultado Final:
[Game]
Library=RGSS301.dll
Scripts=Data\Scripts.rvdata2
Title=Nome do seu jogo (aparecerá na janela)

Existe também um jeito fácil e prático de exportar todos os recursos que você utilizar do RTP em seu jogo. Isso é possível graças à este script:
http://www.mundorpgmaker.com.br/topic/105138-gab-rtp-export/

Basta colar e utilizar.
O único ruim é que ele é apenas para RGSS3, ou seja, RPG Maker VX Ace. Para aqueles que usam outras versões, o jeito mais prático e correto é os citados acima.

Muito bom, unico problema é que a mundo rpg maker ta fora do ar.
se tiver como disponibilizar esse script por outro link ajudaria muito.