Bom minha dúvida é o seguinte:

O que é melhor um servidor com banco de dados ou um servidor que trata informações como o do Cidiomar em Ruby?

Estou com essa dúvida algum programador experiente poderia me ajudar?

servidor que trata diretamente acho que é mais veloz na inicialização, o servidor do paulo em C# ele faz assim porém esse pensa em por para Mysql que na inicialização é mais lenta porém é mais estável no decorrer fora a segurança e estabilidade e velocidade ao decorrer.

Aconselho estudar e ir acompanhando as versões do servidor em C# que Paulo faz.

Tanto faz, se tu tem conhecimento pra fazer de forma bem feita faça da maneira que achar melhor.
Bancos de dados que usam SQL com linguagem são mais fáceis de se usar (não necessariamente mais rápido), são mais seguros (pois tem todo um processo de segurança implementado). Porém no final das contas eles também são iniciados com arquivos binários, porém todo o banco de dados fica na memória pra trabalhar de forma rápida.
Você pode muito bem fazer o mesmo sem ter que usar um MySQL ou SQLce.

Obrigado pela Opinião de Todos. 

Estou estudando Melhor a estrutura em SQL eu vi muitos erros no Servidor do Telam e vou Corrigi-los para Assim Criar um NP do Zero